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佐助决定离开木叶，主要还是受到鼬的刺激。三代死后，鼬就回到了木叶村，不仅‘调戏’了卡卡西，也毒打了一顿自己的弟弟。然而佐助以为自己辛辛苦苦修炼而来的实力，能够与鼬开始一较高下， 但实力差距再次打醒了佐助的‘白日梦’。鼬用月读幻术，再次将佐助放回被灭族的那一晚，24小时的无限循环灭族，给佐助在精神与心理上带来极大的负担以及憎恨的刺激。佐助感到自己无能、无力的这种情况，肯定会渴望力量，离开木叶也成为了必然。
其次原因就是大蛇丸的隆重邀请，大蛇丸基本是对佐助是相当的照顾了，从咒印为开端，佐助见识到了大蛇丸的真本事以后，佐助算是找对了命中注定的人。能够利用一切手段提升佐助实力的人也只有大蛇丸，卡卡西的水平对于佐助来说已经是达到了极限。对于佐助来说，他与卡卡西之间的差距就差在熟练、合理、巧妙的运用自己的写轮眼瞳力，继续待在木叶这边，是没有绝对实力上的增强的。
所以，综合来看，佐助离开木叶还是对的。寻求不为人道的力量，那么必然就要去找大蛇丸。品尝到咒印力量的佐助，内心肯定是对这一点相当明白的。宇智波佐助在没有上忍者学校的时候，也是一个活泼可爱的孩子，但是在他七岁左右，鼬把全族的人都灭了，自己的哥哥一下子变成这样，亲人变成了仇人，这以后他就像换了个人一样。
佐助知道是鼬是仇人之后，他心里就只有一个想法，那就是亲自了结自己的哥哥，好为自己族人和家人报仇。为了替自己族人报仇，宇智波佐助在忍者学校，非常努力的学习，从忍者学校毕业后，又学会了千鸟。但是他在中忍考试中遇见了大蛇丸，大蛇丸随随便便就把他吓得不敢动。大蛇丸也是宇智波佐助遇见的最强人之一，而且蛇叔还给了他帮助，佐助拥有咒印力量后，一瞬间就把需要用全力打败的对手干掉了。大蛇丸走之前还对宇智波佐助说，要想变得更加强大，就去音忍村去找他。
中忍考试后，佐助发现鸣人的实力越来越强，甚至都快要超过他了。佐助觉得自己在木叶村并不能得到很好的试炼，想更快的变强，最后佐助想起来大蛇丸的话，就想去找大蛇丸。鸣人阻拦过他，但是佐助一心想着报仇，只追求力量，就没有听鸣人的话。虽然佐助去找大蛇丸去了，但是木叶村的高层，一直没有正式发文说佐助是叛忍，直到纲手受伤昏迷，团藏得到权利时候，才把佐助分为叛忍。佐助叛逃木叶最大原因就是，木叶村无法教会他厉害忍术，学不会厉害忍术，就不能为自己族人报仇，所以佐助才会去找蛇叔历练。
三代火影以及诸多优秀忍者的身亡，对木叶毫无疑问是一个重大打击。纲手回归木叶之后，为了不让其他国家觉得木叶势弱，采取了相应的措施。也就是：最大程度的缩减留村的上忍，把他们分配到外面去进行任务。不评价纲手这个做法是好是坏，因为这个原因，导致当时能拿来应对佐助叛逃的战斗力不多。最终只拿出了一个中忍，四个下忍的小队。而且除了鸣人以外，剩下的成员是鹿丸自己去找的。有一个细节非常重要，他们的小队找到三个人之后，鹿丸就决定出发，不过他还对着成员说了一句，如果我们到村子门口之前没有遇到第四个成员，我们就以现在的阵容出发。
避免当时损失惨重的木叶和其他国家的战争才是当务之急，所以在派遣战力的时候有一定保留。不知火玄间两人告诉纲手派下忍小队去没胜算，纲手也表示，一定要尽力避免和其他国家的战争。即便会因此让大蛇丸得到写轮眼，她也不会改变策略。卡卡西归来后，纲手也已经决定了卡卡西的下一个任务。但卡卡西执意要去增援鹿丸小队，纲手此时才默许。如果卡卡西去早点还好，可是他从木叶出发的时候，鸣佐已经在终结谷开打了。
想阻止佐助叛逃，要从根本上改变甚至磨灭佐助的复仇意志。鸣人力量不足，当然，最现实的原因，还是这一点。根据剧情的表现，靠嘴说服佐助已经不可能。那么接下来靠的，就是力量了。实际上，鸣佐的力量在当时也是差不多的，常态情况下，打得有来有回。不过佐助变成三勾玉＋咒印二时，战斗进入最终局面。此时情况已经对鸣人不利了，一尾状态和咒印二都对身体有巨大伤害，鸣人已经坚持了很久，直到手都没有了知觉。最后鸣人倒下，佐助离开。
